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肥胖是一种复杂的疾病，与许多代谢和炎症性疾病有关，包括心血管疾病、血脂异常、2 型糖尿病（T2D）、自身免疫性疾病、癌症和免疫反应改变。与肥胖有关的免疫学变化主要是由脂肪组织结构的改变和脂肪细胞分泌的炎性化合物增加引起的。这些变化导致促炎细胞因子分泌增加。因此，肥胖被认为是一种低强度的炎症状态，会对肠道粘膜等免疫区域产生影响。

背景：目前还没有通过元基因组测序对重症哮喘患者的气道微生物组进行物种水平的描述，也没有明确“2型低”中性粒细胞哮喘患者的特定物种与黏膜免疫反应之间的关系。我们将物种水平的元基因组数据与炎症介质进行了整合，以确定主要潜在致病微生物的流行率和宿主免疫反应的特征。

特应性皮炎（AD）是一种慢性炎症性皮肤病，具有多方面的发病机制。众所周知，遗传易感性、免疫异常、屏障功能障碍和环境因素等各种因素错综复杂地交织在一起，形成了该病的发病机制。虽然对这些因素的单独分析逐步加深了我们对AD复杂病理生理学的理解，但由于其固有的复杂性，要完全掌握其全部机制仍是一项挑战。多层次组学（multi-omics）是一种整合多种组学数据集（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学）的方法，已成为揭示疾病复杂分子机制的有力方法。整合多种全息数据集使研究人员能够确定疾病背后复杂的分子网络和潜在的治疗靶点。然而，由于成本和技术上的挑战，通过多组学对AD进行全面分析仍处于起步阶段。本综述旨在从多组学分析的角度，全面概述目前对AD发病机制及其亚群的理解。它将介绍和评估针对AD进行的单项组学分析，深入探讨这些研究如何促进了我们对现有知识的了解。此外，该综述还将讨论多层次的全局组学分析，重点介绍这些分析为了解AD的病理生理学所提供的见解，最后还将讨论这一不断发展的领域的未来研究方向。

背景  婴儿肠绞痛是一种随着时间推移而缓解的良性疾病，新生儿在出生后的头几个月会反复出现过度哭闹和/或不适。婴儿肠绞痛比较常见，但人们对其日后的临床表现了解有限。母乳喂养可能与肠绞痛风险的降低有关，也有人认为母乳和婴儿配方奶粉中的过敏原可能会引发过敏症状并导致婴儿肠绞痛，但结果并不一致。于是我们评估了生命早期肠道微生物组在婴儿肠绞痛以及日后发展成特应性疾病和胃肠道疾病中的作用。

背景　特应性皮炎(AD)是一种慢性、瘙痒性的皮肤炎症，其主要特征为皮肤屏障功能损害和免疫调节失衡。它通常在生命早期发生，并且在儿童中更为常见，发病率高达25%。AD是一种复杂的疾病，其综合负担包括身体不适、睡眠障碍、日常活动受限，并对儿童及其护理者产生深远的心理社会影响。除了这些挑战之外，患有AD的儿童通常会经历多种并发症，例如食物过敏(FA)、过敏性鼻炎、哮喘、自身免疫性疾病以及复发性皮肤感染。儿童AD的发病机制涉及复杂的遗传因素、皮肤屏障缺陷、Th2细胞因子失衡、过敏原致敏以及微生物相互作用。特别是，早期发病和严重的AD是儿童FA发展的重要风险因素。皮肤是人体最大的器官，在提供屏障保护、感觉调节、免疫和热稳态方面起着至关重要的作用。它与广泛存在的细菌、真菌、螨虫、病毒和古生物群落相互寄生，这些微生物之间的相互作用对健康和疾病状态产生影响。测序技术的最新进展揭示了健康皮肤上多样化的皮肤微生物群落，并且在人类和模型系统中增加了微生物与宿主相互作用的研究，研究表明在病原体、共生微生物和免疫系统之间存在着微妙的平衡。然而，在患有AD的儿童中，这种皮肤微生物群发生了改变。这篇综述强调了儿童AD和FA发展中已知的机制途径，以及对皮肤微生物群在儿童AD和FA中作用的新认识。此外，它还探讨了最近研究揭示出来的皮肤微生物群在治疗和预防这些疾病方面具有潜力。

背景：过敏性支气管肺曲霉菌病（ABPA）在无论是特应性还是非特应性的哮喘存在或不存在的情况下发展。本研究试图探索该疾病发病机制中的基本成分，这些成分根据哮喘的存在和类型是一致的或可变的。

背景：肥大细胞（MC）由罕见的外周血循环MC祖细胞（MCps）群体发育而来。本研究研究了在花粉季节对桦树花粉敏感的哮喘患者中，与非季节相比，循环MCps的频率是否发生了改变。

背景：过敏性鼻炎(AR)是世界范围内最常见的慢性疾病之一。关于AR持续性和缓解的前瞻性长期数据有限。本研究的目的是调查花粉诱导的AR(花粉- AR)从童年到成年早期20年的自然过程。

背景：食物引起的食管即时反应(FIRE)是嗜酸性粒细胞食管炎(EoE)患者中出现的一种新现象。当触发性食物与食道表面接触后突然出现令人不快的症状，并在反复接触后复发时可怀疑为FIRE。它经常被误认为是花粉食物过敏综合征(PFAS)和固体食物吞咽困难。关于FIRE的数据仅限于一项调查研究和病例报告，并且没有对成人或儿童EoE进行筛查研究。在这项研究中，我们的目的是筛查≥7岁的EoE儿童是否患有FIRE。

目的：评估食物过敏对偏头痛病程的影响。

背景：本研究的目的是使用人口统计学因素匹配的对照受试者来评估哮喘和偏头痛之间的双向关联。

背景：糖皮质激素（GC）对治疗肺部炎症性疾病有效，然而长期使用会导致严重的副作用。内源性GC可以通过11β-羟化酶（Cyp11b1）依赖的方式从胆固醇中重新合成，或通过11β-羟基类固醇脱氢酶1（Hsd11b1）从11-脱氢皮质酮/可的松中重新激活。本研究的目的是确定呼吸树内源性GC合成的分子途径，为理解局部GC合成如何促进组织内环境稳定提供基础。

背景：烟曲霉特异性免疫球蛋白G（Af-sIgG）已被用于诊断过敏性支气管肺曲霉菌病（ABPA），这是一种对真菌在下呼吸道定植的超敏反应。据报道在上呼吸道，Af-sIgG也与过敏性真菌性鼻窦炎和局部真菌性鼻窦炎有关。然而，在原发性慢性鼻窦炎（CRS）这一更常见的上呼吸道疾病中，Af-sIgG的作用尚不清楚。

背景：食物特异性免疫球蛋白G4（FS-IgG4）与嗜酸性食管炎（EoE）有关；然而，目前尚不清楚它的产生是否仅限于食道。

背景：临床和实验分析表明，过敏原IgE抗体表位-副表位的相互交联是导致效应细胞活化和lgE介导的食物过敏的主要初始步骤。本研究的目的是初步研究和评估阿糖胞苷H2特异性IgE表位样肽，它可以结合过敏原特异性IgE副表位和抑制效应细胞活化。

背景：花生过敏影响1%~2%的欧洲儿童。在饮食中尽早引入花生可以减少高危婴儿的过敏。

背景：已知金黄色葡萄球菌定植会导致特应性皮炎（AD）患者的皮肤屏障破坏。然而，金黄色葡萄球菌如何诱导异常的表皮脂质组成和皮肤屏障功能障碍尚未得到研究。

背景：各种过敏性疾病通常在儿童早期共同发展，但在发病、缓解和进展的时间上有所不同。随着时间的推移，他们的病程往往很难预测，而且决定因素也不太清楚。

序言：慢性疼痛与胃肠道（GI）功能有关，因为食物成分通过对胃肠道免疫和/或神经系统的作用来影响炎症和疼痛，而且许多镇痛药与肠道相互作用，改变其结构和功能。免疫球蛋白G4 (IgG4)是肠道免疫系统暴露于营养物质而产生的食物特异性抗体。目前已发现高IgG4水平与炎症有关。

背景：哮喘是儿童期最常见的慢性疾病之一，在过去几十年中，其发病率一直在增加。最一致的流行病学调查结果显示，生活在农业或农村环境中的儿童免受哮喘和过敏的发展，但中国农村地区的保护因素尚不清楚。